MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 39574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
39501	NC_014002	ACC	2	6	2008525	2008530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496675
39502	NC_014002	AAAG	2	8	2008582	2008589	75 %	0 %	25 %	0 %	294496675
39503	NC_014002	TCA	2	6	2008630	2008635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496675
39504	NC_014002	GAT	2	6	2008668	2008673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496675
39505	NC_014002	GA	3	6	2008698	2008703	50 %	0 %	50 %	0 %	294496675
39506	NC_014002	GCC	2	6	2008757	2008762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496675
39507	NC_014002	CTGC	2	8	2008785	2008792	0 %	25 %	25 %	50 %	294496675
39508	NC_014002	TCA	2	6	2008809	2008814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496675
39509	NC_014002	GCA	2	6	2008827	2008832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496675
39510	NC_014002	ACTGTA	2	12	2008866	2008877	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294496675
39511	NC_014002	ATC	2	6	2008907	2008912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496675
39512	NC_014002	T	6	6	2008963	2008968	0 %	100 %	0 %	0 %	294496675
39513	NC_014002	CTG	2	6	2009053	2009058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496675
39514	NC_014002	AGC	2	6	2009133	2009138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496675
39515	NC_014002	A	6	6	2009151	2009156	100 %	0 %	0 %	0 %	294496675
39516	NC_014002	AGC	2	6	2009175	2009180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496675
39517	NC_014002	AT	3	6	2009191	2009196	50 %	50 %	0 %	0 %	294496675
39518	NC_014002	CAT	2	6	2009224	2009229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496675
39519	NC_014002	T	6	6	2009305	2009310	0 %	100 %	0 %	0 %	294496675
39520	NC_014002	CCA	2	6	2009329	2009334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496675
39521	NC_014002	AGGAGC	2	12	2009348	2009359	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	294496675
39522	NC_014002	TGG	2	6	2009416	2009421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496675
39523	NC_014002	GAT	2	6	2009553	2009558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496676
39524	NC_014002	GGC	2	6	2009582	2009587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496676
39525	NC_014002	TTA	2	6	2009593	2009598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496676
39526	NC_014002	TCA	2	6	2009663	2009668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496676
39527	NC_014002	TCA	2	6	2009849	2009854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496676
39528	NC_014002	CAG	2	6	2009891	2009896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496676
39529	NC_014002	TTC	2	6	2009904	2009909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496676
39530	NC_014002	CAA	2	6	2009943	2009948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496676
39531	NC_014002	CAG	2	6	2009991	2009996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496676
39532	NC_014002	A	6	6	2010003	2010008	100 %	0 %	0 %	0 %	294496676
39533	NC_014002	TA	3	6	2010042	2010047	50 %	50 %	0 %	0 %	294496676
39534	NC_014002	A	6	6	2010063	2010068	100 %	0 %	0 %	0 %	294496676
39535	NC_014002	CCA	2	6	2010085	2010090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496676
39536	NC_014002	CAT	2	6	2010195	2010200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496676
39537	NC_014002	A	6	6	2010241	2010246	100 %	0 %	0 %	0 %	294496676
39538	NC_014002	TTAT	2	8	2010346	2010353	25 %	75 %	0 %	0 %	294496676
39539	NC_014002	T	7	7	2010366	2010372	0 %	100 %	0 %	0 %	294496676
39540	NC_014002	A	6	6	2010503	2010508	100 %	0 %	0 %	0 %	294496676
39541	NC_014002	AAGAA	2	10	2010534	2010543	80 %	0 %	20 %	0 %	294496676
39542	NC_014002	AAG	2	6	2010587	2010592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496676
39543	NC_014002	TAT	2	6	2010621	2010626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39544	NC_014002	AT	3	6	2010765	2010770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39545	NC_014002	ATC	2	6	2010849	2010854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39546	NC_014002	T	7	7	2010885	2010891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39547	NC_014002	ACA	2	6	2010908	2010913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496677
39548	NC_014002	TCA	2	6	2011080	2011085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496677
39549	NC_014002	CAA	2	6	2011128	2011133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496677
39550	NC_014002	GTCA	2	8	2011138	2011145	25 %	25 %	25 %	25 %	294496677
39551	NC_014002	TTC	2	6	2011182	2011187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496677
39552	NC_014002	GCT	2	6	2011223	2011228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496677
39553	NC_014002	ACTG	2	8	2011254	2011261	25 %	25 %	25 %	25 %	294496677
39554	NC_014002	ATCAAG	2	12	2011297	2011308	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294496677
39555	NC_014002	TCC	2	6	2011327	2011332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294496677
39556	NC_014002	AGA	2	6	2011378	2011383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496677
39557	NC_014002	ATTTAT	2	12	2011407	2011418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496677
39558	NC_014002	GCC	2	6	2011441	2011446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496677
39559	NC_014002	GTA	2	6	2011532	2011537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496677
39560	NC_014002	TACC	2	8	2011545	2011552	25 %	25 %	0 %	50 %	294496677
39561	NC_014002	AAC	2	6	2011690	2011695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496677
39562	NC_014002	ATTACG	2	12	2011720	2011731	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294496677
39563	NC_014002	CCT	2	6	2011766	2011771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294496677
39564	NC_014002	TTC	2	6	2011834	2011839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496677
39565	NC_014002	ATGCT	2	10	2011906	2011915	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39566	NC_014002	AGA	2	6	2012047	2012052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39567	NC_014002	AGTTT	2	10	2012155	2012164	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39568	NC_014002	A	6	6	2012166	2012171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39569	NC_014002	TA	3	6	2012195	2012200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39570	NC_014002	CT	3	6	2012208	2012213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39571	NC_014002	T	6	6	2012229	2012234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39572	NC_014002	T	6	6	2012261	2012266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39573	NC_014002	TC	4	8	2012293	2012300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39574	NC_014002	T	7	7	2012338	2012344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.